Ubuntu 17.04 - JDK 9 с выпуском IntelliJ IDEA 2017.2.3

apt-get установить пакеты из http://packages.ubuntu.com/ репозитория. Ubuntu кэширует все метаданные пакетов на компьютере. Вы можете искать свои пакеты с помощью следующей команды.

sudo apt-cache search "package keyword"

искать библиотеку HDF5 в репозитории пакетов ubuntu.

sudo apt-cache search "hdf5"

Команда покажет пакеты, относящиеся к hdf5.

установите соответствующий пакет для вас.

sudo apt-get install package-name. 

в основном вам нужно установить hdf5-tools, h5utils, python-tables.