Программа установки не видит окна

Он жестко закодирован в источниках.

Быстрый шаг за шагом.

sudo apt-get install build-essential
apt-get source unity-greeter
sudo apt-get build-dep unity-greeter
cd unity-greeter-0.1.1/src/
vim user-list.vala +252

Удалите строку или просто добавьте // в начале строки. Сохранить и выйти.

cd ..
dpkg-buildpackage -rfakeroot -uc -b
cd ..
sudo dpkg -i unity-greeter_0.1.1-0ubuntu1_*.deb

Ubuntu попытается заменить специально созданный пакет при выполнении обновления системы. Просто снимите флажок «Единство», чтобы сохранить пользовательский или переустановить пользовательский, используя «dpkg» после обновления.

[Edit]

Чтобы администратор пакетов не заменил ваше индивидуальное единство -greeter просто запустить

sudo apt-mark hold unity-greeter