Я никогда не замечал никакой разницы в поведении ubuntu с безопасной загрузкой вкл. или выкл., несмотря на то, что ему было предложено включить и отключить его по разным причинам.
Безопасная загрузка - это не более чем маркетинговая концепция, которая не добавляет реальных безопасности в системах Linux, но помогает смягчить некоторые уязвимости загрузочного сектора, которые в прошлом преследовали окна.