Чтобы удалить установку wubi из Windows, откройте панель управления и выберите «Добавить / удалить приложения». Ubuntu появится в списке приложений для удаления.
Когда вы используете Wubi, очень важно, чтобы вы всегда выключали систему должным образом. В противном случае корневая файловая система будет недоступна. Это означает, что и Windows, и Ubuntu должны всегда быть корректно выключены.
Более подробную информацию см. на этой странице: https://wiki.ubuntu.com/WubiGuide