По какой-то причине, когда я использую Jmol, он не отображает неявных водородов, даже когда у меня отмечен флажок «Показывать водород». Как мне преодолеть эту проблему? Я использую 32-битный 12.10 на ноутбуке Dell Vostro 3500 с 3,7 ГБ ОЗУ и 4 2,53 ГГц процессорами . Это никогда не работало для меня. Когда я захожу в меню панели «Юнити» и нажимаю «Об этом компьютере», всплывающее окно сообщает мне, что у меня неизвестная графика . Когда я перехожу на страницу http://chemapps.stolaf.edu/jmol/jmol.php , в которую встроен jmol, я вижу неявные водороды.
Зайдите в меню «Файл» в верхней части экрана , спуститесь вниз и выберите «консоль». В типе консоли calculate hydrogen
для отдельных моделей. Если вы используете файлы PDB для импорта трехмерных структур, вы также можете использовать код консоли set pdbAddHydrogens TRUE