Macbook 8,1 Ubuntu 12.10 CPU Heat

Попробуйте следующее:

gconftool-2 --type bool --set /apps/metacity/general/compositing_manager "false"

Metacity имеет менеджер компоновки, который работает не очень хорошо, его нельзя активировать по умолчанию, но ваша проблема заставляет меня думать, что он активирован.

После этого перезапустите и проверьте, не возникла ли проблема.