Я не знаю, где они хранятся, но я знаю, как вы можете добавить пусковую установку.
Если вы используете Wine для Notepad ++ и уже имеете пусковую установку, просто перетащите исполняемый файл в панель запуска должно быть достаточно.
Google Hangouts работает для меня хорошо для видеоконференций группы в Linux.
Нет ничего свободного, о котором я знаю.
Вы можете делать все, что хотите, с помощью Skype Pro за 9 долларов США в месяц, и у них есть клиенты для каждой платформы, включая Ubuntu.