Как завершить стандартный ввод без символа новой строки?

Ctrl-D не работает только над новой строкой, как Вы говорите. Взять rev например, который инвертирует каждую входную строку.

Обычно, Вы нажимаете Enter, после того, как введено, и он инвертирует ту строку:

$ rev
asdf
fdsa

Если Вы не хотите добавлять новую строку к своему входу, просто нажмите Ctrl-D дважды после ввода asdf, это будет инвертировано в той же строке:

$ rev
asdffdsa

Различные программы обрабатывают это по-другому; например, bc не ведет себя как вышеупомянутый.