Какое свободное программное обеспечение вы можете использовать для создания вращающихся 3D-моделей Spacefill молекул в формате .gif?

Думаю, я понял это. Вы должны заменить (после резервного копирования, для безопасности) следующие три папки с оригинальными ранее сохраненными из системы, которую вы хотите клонировать:

~/.local/share/gnome-shell/extensions

~/.local/share/gnome-shell/quicklaunch [ ! d2]

~/.config/dconf

Затем выйдите из системы и войдите в систему.

Сообщите мне, если это работает, или если вы найдете лучшие пути!

тестируется на Ubuntu Gnome Shell Remix 12.04)

1
задан 9 March 2017 в 22:04

2 ответа

Я бы порекомендовал вам посмотреть пакеты UbuntuScience, чтобы вы начали.

Существует довольно много программных, а также визуальных программных пакетов, которые уже доступны в основных хранилищах.

В качестве примера рассмотрим gdis в разделе UbuntuScience на странице UbuntuScience.

Эта конкретная часть программного обеспечения представляет собой «молекулярную программу отображения, которая поддерживает рендеринг OpenGL и POVRay».

Чтобы установить gdis, запустите следующие команды с вашего терминала (ctrl + alt + T):

sudo apt-get install gdis

Для установки этого пакета также потребуется установить следующие зависимости:

gdis-data
openbabel

После того, как он установлен, откройте программу из вашего меню.

В моем случае, запустив Xfce, я перейду в Меню приложений -> Образование -> GDIS Data Modeler. Или вы можете открыть терминал (ctrl + alt + T) и набрать gdis.

После открытия приложения перейдите в Файл -> Открыть.

Оттуда , перейдите к /usr/share/gdis/models, чтобы открыть образец файла:

. В этом примере откройте файл /usr/share/gdis/models/arag.gin:

для запуска вращательной анимации молекулы:

Оттуда перейдите к /usr/share/gdis/models, чтобы открыть образец файла:

Щелкните правой кнопкой мыши на молекуле и перетащите указатель мыши на несколько секунд. Вернуться к меню - выберите «Инструменты» -> «Визуализация» -> «Анимация». Теперь выберите кнопку «Воспроизвести», чтобы воспроизвести ваши действия молекула:

Для базового тура по GDIS взгляните на их UbuntuScience .

4
ответ дан 24 May 2018 в 23:52
  • 1
    Вы не сказали мне, что нажать после входа в подменю визуализации. Не могли бы вы указать? Я предполагаю, что это анимация, но анимация вообще ничего не делает для меня. – BH2017 4 April 2013 в 13:57

Molgif

Вы также можете использовать molgif. Это инструмент командной строки для создания анимаций Gif молекул из xyz-файлов.

molgif caffeine.xyz

3
ответ дан 24 May 2018 в 23:52

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: