сжать все файлы fastq до fastq.gz

У меня есть имена файлов fastq, например:

Soil-53_R1_001.fastq Root-29_S27_L001_R2_001.fastq
Soil-53_R2_001.fastq Root-2_S35_L001_R1_001.fastq
Soil-54_R1_001.fastq Root-2_S35_L001_R2_001.fastq
Soil-54_R2_001.fastq

и я хочу, чтобы все они сжимались в формате fastq.gz, пожалуйста, предложите, как я могу это сделать с помощью одного команда.

0
задан 25 June 2019 в 00:27

1 ответ

gzip *.fastq

создаст сжатый файл для любого файла, заканчивающегося на .fastq

gzip -r {dir}

создаст сжатый файл для любого файла, найденного в {dir}.

(сам gzip никогда не создает 1 файл. Вы можете использовать tar с опцией z для сжатия)

0
ответ дан 25 June 2019 в 00:27

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: