bash: синтаксическая ошибка рядом с неожиданным токеном `('

Это из-за скобок. Вам нужно убежать от них так:

wget  http://www.flareget.com/files/flareget/debs/amd64/flareget_2.3-24_amd64\(stable\)_deb.tar.gz

Теперь это должно сработать.

Вы должны использовать одинарные кавычки ' или двойные кавычки " вокруг URL в этом случае (и в целом):

wget  'http://www.flareget.com/files/flareget/debs/amd64/flareget_2.3-24_amd64(stable)_deb.tar.gz'

С этого момента, вы должны использовать этот метод в целом, когда вы используйте строку, которая содержит скобки в качестве аргумента в команде. Это связано с тем, что круглые скобки используются для группировки оболочкой таким образом, что они никак не передаются команде. Итак, оболочка bash выдаст вам синтаксическую ошибку:

$ echo some (parentheses)
bash: syntax error near unexpected token `('
$ echo 'some (parentheses)'
some (parentheses)