Удалите строку из файла, который называют в другом

Question 1

У меня есть следующий список:

NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000022 0
NM_000023 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

И у меня есть другой файл только с первым столбцом:

NM_000031
NM_000032
NM_000033
NM_000034
NM_000022
NM_000035
NM_000036
NM_000037
NM_000023
NM_000038
NM_000039
NM_000040
NM_000041
NM_000042

Я хочу удалить целые строки первого файла, которые называют как второе. В этом случае выходной файл будет:

NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

(удаляющий NM_000022 и NM_00023 с его соответствующими значениями)

Спасибо!!

Question 2

С awk:

awk 'NR==FNR {a[$0]; next}; {if ($1 in a) next}; 1' f1.txt f2.txt

Введите файл только с отдельным столбцом как первый аргумент и тот для проверки на (первый столбец) членство как второй аргумент.

NR==FNR {a[$0]; next}, здесь NR==FNR только будет верно для первого файла, затем мы сохраняем каждую строку в массив a так, чтобы мы могли сделать тест членства для первого аргумента второго файла, затем мы идем в следующую строку без дальнейшей операции на втором файле
{if ($1 in a) next}; 1 будет выполняться только для второго файла, тот для проверки, здесь мы проверяем, отделился ли пробел, первый аргумент находится в массиве a, если существующий затем движение к следующей строке, иначе печатающей целую строку.

Пример:

$ cat f1.txt 
NM_000031
NM_000032
NM_000033
NM_000034
NM_000022
NM_000035
NM_000036
NM_000037
NM_000023
NM_000038
NM_000039
NM_000040
NM_000041
NM_000042

$ cat f2.txt 
NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000022 0
NM_000023 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

$ awk 'NR==FNR {a[$0]; next}; {if ($1 in a) next}; 1' f1.txt f2.txt
NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

Question 3

Question 4

Можно также использовать sed с циклом Bash.

Эта команда изменяет file1 на месте (создающий резервное копирование file1.bak), удаляя каждую строку, которая запускается с любой строки от file2:

while read line ; do sed -i.bak "/$line.*/d" file1 ; done < file2

Question 5

Как с командой 'grep' здесь:)

grep -Fvf oneColumnedFile listFile > outfile

heemayl · Accepted Answer · 23 November 2019 в 08:54

С awk:

awk 'NR==FNR {a[$0]; next}; {if ($1 in a) next}; 1' f1.txt f2.txt

Введите файл только с отдельным столбцом как первый аргумент и тот для проверки на (первый столбец) членство как второй аргумент.

NR==FNR {a[$0]; next}, здесь NR==FNR только будет верно для первого файла, затем мы сохраняем каждую строку в массив a так, чтобы мы могли сделать тест членства для первого аргумента второго файла, затем мы идем в следующую строку без дальнейшей операции на втором файле
{if ($1 in a) next}; 1 будет выполняться только для второго файла, тот для проверки, здесь мы проверяем, отделился ли пробел, первый аргумент находится в массиве a, если существующий затем движение к следующей строке, иначе печатающей целую строку.

Пример:

$ cat f1.txt 
NM_000031
NM_000032
NM_000033
NM_000034
NM_000022
NM_000035
NM_000036
NM_000037
NM_000023
NM_000038
NM_000039
NM_000040
NM_000041
NM_000042

$ cat f2.txt 
NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000022 0
NM_000023 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

$ awk 'NR==FNR {a[$0]; next}; {if ($1 in a) next}; 1' f1.txt f2.txt
NM_000014 3
NM_000015 0
NM_000016 0
NM_000017 0
NM_000018 0
NM_000019 28
NM_000020 0
NM_000021 0
NM_000024 8
NM_000025 0
NM_000026 0

Byte Commander · Answer 2 · 23 November 2019 в 08:54

Можно также использовать sed с циклом Bash.

Эта команда изменяет file1 на месте (создающий резервное копирование file1.bak), удаляя каждую строку, которая запускается с любой строки от file2:

while read line ; do sed -i.bak "/$line.*/d" file1 ; done < file2

αғsнιη · Answer 3 · 23 November 2019 в 08:54

Как с командой 'grep' здесь:)

grep -Fvf oneColumnedFile listFile > outfile

1

ответ дан αғsнιη 23 November 2019 в 08:54

Удалите строку из файла, который называют в другом

3 ответа

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: