Набор LD_LIBRARY_PATH правильно

Я использую Докера с изображением Ubuntu 16.04. Я использую этого докера для выполнения:

  • Импортируйте классы C++ в Python с помощью boost.python
  • Импортируйте пакет Python matlab в Python со справкой Время выполнения Matlab (MCR).

Прежде чем я установил MCR в докере, я установил использование повышения:

$ sudo apt-get install -y libboost-all-dev

и я смог перенести классы C++ и назвать их в Python. Затем я установил MCR, и одно из требования должно установить LD_LIBRARY_PATH к библиотеке Matlab.

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

Это работало, я смог выполнить пакет Python matlab в Python, но тестирование оберток классов C++ перестало работать из-за изменения LD_LIBRARY_PATH. Например, я получаю следующую ошибку, когда я пытаюсь импортировать класс C++ в Python:

 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0: undefined symbol: XML_SetHashSalt

Если я сбросил LD_LIBRARY_PATH Работы импорта C++, но сбои MCR. Так вопрос, что LD_LIBRARY_PATH должен быть в порядке для выполнения обоих классов C++ и пакета Python Matlab успешно?

Я попытался добавить путь для повышения библиотек к LD_LIBRARY_PATH но не работал, таким образом, огибающее значение будет:

/usr/lib/x86_64-linux-gnu:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64

Править

зависимости файла библиотеки C++ прежде, чем установить LD_LIBRARY_PATH:

linux-vdso.so.1 (0x00007ffcee0dc000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007f9d69e59000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007f9d69c09000)
    libstdc++.so.6 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 (0x00007f9d698fe000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007f9d695fd000)
    libgcc_s.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libgcc_s.so.1 (0x00007f9d693e7000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007f9d6903c000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007f9d68e34000)
    libexpat.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so.1 (0x00007f9d68c0b000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007f9d689f0000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007f9d687d3000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007f9d685cf000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007f9d683cc000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007f9d6a6c3000)

После установки the LD_LIBRARY_PATH:

linux-vdso.so.1 (0x00007ffc42e9b000)
    libpython3.4m.so.1.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.4m.so.1.0 (0x00007fad9635b000)
    libboost_python-py34.so.1.55.0 => /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libboost_python-py34.so.1.55.0 (0x00007fad9610b000)
    libstdc++.so.6 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6 (0x00007fad95d8a000)
    libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007fad95a89000)
    libgcc_s.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64/libgcc_s.so.1 (0x00007fad95873000)
    libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fad954c8000)
    librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007fad952c0000)
    libexpat.so.1 => /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64/libexpat.so.1 (0x00007fad95095000)
    libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007fad94e7a000)
    libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fad94c5d000)
    libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007fad94a59000)
    libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007fad94856000)
    /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007fad96bc5000)
6
задан 17 August 2018 в 06:02

3 ответа

Единственный способ, которым он работал для меня, - это определить LD_PRELOAD и указать его на системную библиотеку. Итак, моя текущая среда будет:

LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/opengl/lib/glnxa64
LD_PRELOAD=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so

Итак, в Docker я создал файл .matlab, который содержит упомянутые переменные env. Затем в dockerfile я добавил следующее:

services:
  django: &django
    build:
      context: .
      dockerfile: ./compose/local/django/Dockerfile
    depends_on:
      - postgres
    volumes:
      - .:/app
      - shared_upload_tmp:/app_temp
      - media:/app/computation_server/media
    env_file:
      - ./.envs/.local/.django
      - ./.envs/.local/.postgres
      - ./.envs/.production/.matlab
    ports:
      - "8800:8000"
    command: /start
1
ответ дан 23 November 2019 в 07:42

Этот Exchange Стека Вопросы и ответы имеет различные способы установить LD_LIBRARY_PATH вершина голосовала за то, что ответ предполагает, что это - лучший способ:

sudo -H gedit /etc/ld.so.conf.d/randomLibs.conf

в файле Вы, как предполагается, пишете полный путь к каталогу, который содержит все библиотеки, которые Вы хотите добавить к системе, например

/home/linux/myLocalLibs

не забудьте добавлять только путь к dir, не, полный путь для файла, весь освобождает в том пути, будет автоматически индексирован.

Сохраните и работайте sudo ldconfig обновить систему с этим освобождает.

4
ответ дан 23 November 2019 в 07:42

Необходимо ли экспортировать LD_LIBRARY_PATH? не можете Вы просто снабдить вызов matlab предисловием с ним, например.

LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/v94/extern/bin/glnxa64 /usr/local/MATLAB/MATLAB_Runtime/...

(Я точно не знаю то, чем исполняемый файл называют как),

Вы могли поместить это в небольшой сценарий

Во-вторых, могло быть возможно изменить rpath исполняемого файла или некоторой библиотеки, таким образом, это смотрит на корректное место непосредственно. Я использую patchelf для этого

patchelf --set-rpath 

С тех пор существуют разнообразные пути, включил его, мог стать немного хитрым, хотя

2
ответ дан 23 November 2019 в 07:42

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: