Если из приложения Skype вышли через закрытие окна, почему это видимо в top
с использованием иногда в 2%?
Обратите внимание также, что это отсутствует в Status Bar
наверху экрана. Значок Skype на Launcher
не показывает белой точки, как имел бы место для открытых приложений.
Закрытие окна не закрывает программу. Это просто отправляет его на задний план. Процесс все еще там, и ваша сессия все еще открыта / жива.
Используйте меню Skype > Выход (или Выйти), чтобы фактически закрыть Skype.
Или можно найти процесс и вручную уничтожить его, как kill -9 $(ps -ef | grep skype)
или: pkill skype