Программное обеспечение Installing для биоинформатики

Я полностью плохо знаком с Linux, получил его, потому что некоторые программы я нуждаюсь для исследования биоинформатики или в работе только над Linux или легко прооперирован из Linux.

В данный момент пытаясь установить программу под названием Mothur. Следующий конвейер установки для linux/unix https://www.mothur.org/wiki/Installation:

1) загруженный программа 2), прошел эти шаги:

mkdir mothur
cd mothur
unzip ../Mothur.source.zip
make

ошибка, которую я получаю, говорит:

make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.

Я понятия не имею, что это означает.

Далее в учебном руководстве это говорит:

Выполнять mothur:

./mothur

Хотелось бы надеяться, mothur откроется в интерактивном режиме.

Это не делает.

Было бы действительно благодарно за некоторую справку.

0
задан 21 December 2016 в 10:15

3 ответа

Просто быстрая проверка и он швы, которые пакет Вы ищете, доступны в существующем выборе программного обеспечения.

Для установки открытого терминала и типа

Sudo apt install mothur

Это должно установить программу, Вы ищете Вас, затем сможет найти его в приложениях установленным в Вашей системе.

Это лучше затем пытается использовать, сделать, если Вы незнакомы с Linux.

2
ответ дан 7 November 2019 в 07:03

Похоже на инвертирование порядка двух команд в инструкциях по установке. Это должно быть:

unzip mothur.zip
cd mothur
make

Эти Makefile используемый make для создания программы из источника в подкаталоге motur из архива исходного кода. Если Вы вызовете make, не говоря это, где искать Makefile, это будет только искать его в текущем рабочем каталоге. (За исключением того, что это использует свой встроенный набор правила сборки, который не включает целевое правило по умолчанию использовать, когда ни один не указан.)

Все, что является несмотря на то, что можно установить Mothur от хранилища пакетов Ubuntu:

sudo apt install mothur
1
ответ дан 7 November 2019 в 07:03

" make: *** No targets specified and no makefile found. Stop." означает, что нет никакого make-файла (содержащий правила позволить make создать Ваше программное обеспечение) в текущем каталоге. После Вашего cd mothur, используйте ls для наблюдения, какие файлы и каталоги были распакованы. Вероятно, будет каталог, названный build, source, или даже src. Ищите файл под названием 'Make-файл', cd к тому каталогу и повторите make.

0
ответ дан 7 November 2019 в 07:03

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: