На этот вопрос уже есть ответ здесь:
У меня двойная загрузка установка с Ubuntu и Wiindows. Я вижу разделы Windows из Ubuntu. Как я могу удалить разрешение на доступ к этим разделам?
Проверьте этот страница - это имеет ответы на Ваш вопрос. Дополнительно можно также попробовать решение, данное Morbius1 здесь
Можно отключить значки от появления на рабочем столе при поиске опций Media в настройках для дистрибутива/рабочего стола. Ничто не будет затронуто разделов Windows, если Вы не настроите его к или дважды щелкаете по одному из тех значков, которые смонтируют диск. Это легко невозможно путем нажатия на кнопку выброса I файловый менеджер все же.