На этот вопрос уже есть ответ:
Можно ли запустить файл .exe в Ubuntu в скрипте? Например, простой код Matlab, например:
system("dir/WAV2RAW.exe")
Как упомянуто в комментариях это может быть проблемой XY
Вы могли использовать 'носки' для преобразования от сырых данных до wav типов файлов:
sudo apt install sox
установит программу, затем
sox --type raw <infile> --type wav <outfile>
выполнил бы простое преобразование от сырых данных до wav форматов
Я думаю, что необходимо использовать Вино.
sudo apt-get install wine
wine dir/WAV2RAW.exe
Или Моно, если Вы знаете, что exe является приложением.NET:
sudo apt install mono-runtime
mono dir/WAV2RAW.exe