Как создать softlinks во все файлы в каталоге в другом каталоге в терминале?

Я думаю, что это - проблема в том, как Вы определяете путь файлов, возможно, при определении полного пути, это могло бы работать.

От man ln:

РЕЗЮМЕ

   ln [OPTION]... [-T] TARGET LINK_NAME   (1st form)
   ln [OPTION]... TARGET                  (2nd form)
   ln [OPTION]... TARGET... DIRECTORY     (3rd form)
   ln [OPTION]... -t DIRECTORY TARGET...  (4th form)

ОПИСАНИЕ

В 1-й форме создайте ссылку для ПРЕДНАЗНАЧЕНИЯ с именем для LINK_NAME. В 2-й форме создайте ссылку для ПРЕДНАЗНАЧЕНИЯ в текущем каталоге. В 3-х и 4-х формах создайте ссылки на каждую ЦЕЛЬ в КАТАЛОГЕ. Создайте жесткие ссылки по умолчанию, символьные ссылки с - символьный.

Читая его тщательно, Вы будете видеть (предполагающий, что исходная папка содержит больше чем один файл) использование 3-й формы. Так как Вы не указывали каталог, последнее имя файла интерпретируется как каталог.

Если Вы в каталоге, Вы хотите создать символьные ссылки в, можно просто добавить . (текущий каталог) в конце команды:

ln -fs ./source/* .