Если я использую команду remove --purge, удалит ли это пакет и файлы конфигурации из моей системы?
Со страницы руководства apt :
При удалении пакета удаляются все упакованные данные, но обычно остаются небольшие (измененные) файлы конфигурации пользователя, в случае, если удаление было несчастный случай. Просто отправив запрос на установку случайно удаленного пакета, вы восстановите его функцию, как и раньше в этом случае. С другой стороны, вы можете избавиться от этих остатков, вызвав очистку даже на уже удаленных пакетах. Обратите внимание, что это не влияет на какие-либо данные или конфигурацию, хранящиеся в вашем домашнем каталоге.
Поэтому, чтобы ответить на ваш вопрос, да.