diff также может сравнивать деревья каталогов.
diff <dir1> <dir2>
Или если вы не хотите видеть различия в содержании файлов:
diff -q <dir1> <dir2>
Некоторые графические инструменты доступный в репозиториях Ubuntu: dirdiff, fldiff, kdiff3, meld, mgdiff.