Сделайте это:
$ cd ~/Desktop
$ idle your_file.py
Я действительно не знаю, что это за сценарий. Где вы его нашли? .../bash/gnuplot кажется, что кто-то действительно запутался.
Но если у вас есть файл с данными, назовите его sourcefile, со структурой
whatever x-data y-data
whatever x-data y-data
whatever x-data y-data
вы можете иметь график рассеяния столбца 3 по сравнению с столбцом 2, входящий в gnuplot, и в приглашении с использованием:
plot "sourcefile" using 2:3
(Хотя ваш скрипт, кажется, делает plot "sourcefile" using 1:3, в отличие от вашего описания, и без кавычки, которые являются синтаксической ошибкой в gnuplot, если sourcefile не является переменной, содержащей имя файла).
Я рекомендую вам прочитать http://people.duke.edu/~hpgavin/gnuplot.html