Отсутствует ошибка расширения PHP imap

Вы можете использовать pynotify вместо командной строки. Это довольно просто и устанавливается по умолчанию в Ubuntu. Быстрый образец:

import pynotify

pynotify.init("Name")
n = pynotify.Notification("Name", "This is a notification")
n.show()