Помимо замечательного, упомянутого Rinzwind, в Ubuntu 12.04 я нашел:
Varnish - это ускоритель веб-приложений. Вы устанавливаете его перед своим веб-приложением, и это значительно ускорит его.
Varnish - это ускоритель HTTP, предназначенный для контент-тяжелых динамических веб-сайтов. В отличие от других ускорителей HTTP, таких как Squid, которые начали работать как клиентский кеш, или Apache и nginx, которые в основном являются исходными серверами, Varnish был разработан с нуля в качестве ускорителя HTTP. Varnish ориентирован исключительно на HTTP, в отличие от других прокси-серверов, которые часто поддерживают FTP, SMTP и другие сетевые протоколы.
https://www.varnish-cache.org/
Ваш скрипт не содержит никакой команды для установки текущего каталога, поэтому он запускается в том же каталоге, что и вызванный им процесс. Когда он выполняется из rc.local, который выполняется из init, текущий каталог является корневым каталогом /.
Добавьте cd /direc/tory/ в свой скрипт. Кстати, обратите внимание, что #!/bin/sh (#!bin/sh работает здесь только потому, что вы выполняете свой скрипт из корневого каталога, это очень плохая идея, чтобы полагаться на это.)
#!/bin/sh
set -e
cd /direc/tory
wget "http://somesite.org/someJava.jar" -O someJavaFile.jar
java -d64 -Xincgc -Xmx512M -jar someJavaFile.jar
Я также добавил set -e в сценарий. Это заставляет его останавливаться, если одна из команд выходит из строя. Например, если wget не может загрузить банку, тогда java не будет выполняться.