Я предполагаю, что если вы можете работать с терминалом, гораздо лучше установить программное обеспечение из него. Вы получаете список пакетов, скорость загрузки, сообщения об ошибках, все виды полезной информации. Но если вы новичок, лучше придерживайтесь Software Center. Нет большой разницы в процессе.