Правильный путь к настройке по умолчанию qt: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/qt-default/qtchooser/default.conf
Вы также можете использовать sed с циклом Bash.
Эта команда изменяет file1 на месте (создавая резервную копию file1.bak), удаляя каждую строку, начинающуюся с любой строки из file2:
while read line ; do sed -i.bak "/$line.*/d" file1 ; done < file2
Как работает команда grep здесь:)
grep -Fvf oneColumnedFile listFile > outfile