Ядро Linux «решает» это. Он делает это с настраиваемым параметром, называемым swappiness.
http://code.google.com/p/irssi-libnotify/ отлично работает для меня.
Если вы хотите, чтобы он уведомил все сообщения, а не только hightighted, удалите || !($dest->{level} & MSGLEVEL_HILIGHT) из скрипт.