iTunes управляет приложениями и синхронизацией данных с устройствами iPod и iOS. libimobiledevice обеспечивает синхронизацию для этих устройств в Ubuntu, не полагаясь на iTunes.

iTunes - это приложение для цифрового мультимедиа-плеера, используемое для воспроизведения и организации цифровых музыкальных и видеофайлов. Приложение также является интерфейсом для управления содержимым на линиях iPod и iPhone Apple, а также iPad.

Для корректной работы с вашим устройством требуется обновленная версия iTunes. Старые версии iTunes могут быть несовместимы с более новыми устройствами. iTunes не требуется и может вообще не работать на Ubuntu, посмотрите статью о PortableDevices / iPhone в Ubuntu Wiki.