Нет, apt-get clean не повредит вашей системе. Пакеты .deb в / var / cache / apt / archives используются системой для установки программного обеспечения. Но как только программное обеспечение установлено, эти пакеты .deb больше не нужны. Эти файлы .deb вам понадобятся только при повторной установке программного обеспечения. Если вам не нужно переустанавливать, удалите эти файлы .deb, используя apt-get clean.