Хорошо, это, кажется, ответ:
http://johnlewis.ie/remove-residual-config-files-in-ubuntu-a-one-liner/
aptitude -F %p search '~c' | xargs dpkg -P
Я попытался скомпоновать что-то подобное, но на основе deborphan, и я, возможно, оставил свою систему в частично разреженном состоянии. Я задам еще один вопрос.