Система, которая отлично работала с 12.04 LTS, не отключится с 16.04

sendkey может использоваться для отправки ключей к виртуальной системе, которые ваш хост перехватывает на низком уровне - например, Ctrl + Alt + F *. Используйте Ctrl + Alt + 2, чтобы переключиться на Консоль QEMU. Введите sendkey ctrl-alt-f1 и нажмите Enter. Используйте Ctrl + Alt + 1, чтобы вернуться к виртуальной системе, которая теперь должна быть на TTY1.

Как только на виртуальном терминале вы сможете использовать команду chvt, например. sudo chvt 7, чтобы вернуться к вашей сессии X.