Я получил то же самое, начиная с вчера, когда я установил обновления. Я обнаружил, что любая команда в .profile, которая генерирует выходные данные, вызывает это. Если вы исключите вывод, команды все еще выполняются, и это диалоговое окно не отображается. Например, у меня была строка вроде этого:
xgamma -gamma 0.7
Я изменил ее на это, и таинственный диалог больше не появляется:
xgamma -gamma 0.7 >& /dev/null
Я не знаю, почему это бывает, это похоже на ошибку. Но, по крайней мере, это заставляет его уйти.