Вы можете вручную отредактировать скрипты, но лучший способ - запустить
sudo update-rc.d webmin enable
, и все необходимые записи будут сделаны чисто - меньше риска поломки основных сценариев запуска.
и наоборот, чтобы отключить
sudo update-rc.d webmin disable