Сервер Ubuntu имеет 4 IP-адреса на одном порту, остальные 3 порта не отвечают

Это должно быть хорошо. AFAIK, в отличие от загрузчика Windows, Grub (вы установили его в MBR, верно?) Не полагается на какую-то запись начального положения раздела, чтобы найти его, но он использует его порядок на диске (пример: «третий раздел на первом диске "). Вот как он находит свои файлы меню, заставки и т. Д. (Смотрите /boot/grub/grub.cfg), поэтому, если вы не измените порядок разделов, он должен работать. Тем не менее, всегда делайте резервные копии важных файлов, прежде чем прикасаться к разделам!