Можно полностью отключить проверку файловой системы на ext-filesystems, используя:
sudo tune2fs -c 0 /dev/sdXY
Это может быть не очень хорошо. Заметки man tune2fs:
Вы должны полностью рассмотреть последствия полностью отключить проверку монтирования. Плохие диски, кабели, память и ошибки ядра могут повредить файловую систему, не загрязняя файловую систему или ошибочно. Если вы используете журналирование в своей файловой системе, ваша файловая система никогда не будет помечена как загрязненная, поэтому обычно ее не проверять. Ошибка файловой системы, обнаруженная ядром, по-прежнему будет вынуждать fsck при следующей перезагрузке, но, возможно, уже слишком поздно, чтобы предотвратить потерю данных в этой точке.