Я нашел этот вопрос, пытаясь сделать это сам, для будущей ссылки вы также можете сделать это следующим образом:
convert *.tiff -set filename: "%t" %[filename:].jpg
или поместить его в подкаталог
mkdir jpg
convert *.tiff -set filename: "%t" jpg/%[filename:].jpg