Вы не можете легко изменить команду, но вы можете заменить команду.
# You only need this one time:
mkdir --mode=755 $HOME/bin
# You need this command once per login (or in $HOME/.bashrc)
PATH="$HOME/bin:$PATH"
Тогда любой исполняемый файл / скрипт в $HOME/bin переопределит любую команду с тем же именем.
Когда вы вводите команду, оболочка ищет исполняемый файл по этому имени в каждом из каталогов в $PATH.
К сожалению, ваш пример exit является «встроенной оболочкой» (см. man bash) и не запрашивается вдоль $PATH, скорее он обрабатывается оболочкой внутри. Чтобы переопределить exit, вам нужно будет определить функцию оболочки или псевдоним (см. [F8]) в вашем $HOME/.bashrc