Лично я бы выполнил команду, чтобы открыть PDF или другие файлы в подоболочке, поставить задержку, чтобы файлы открылись, а затем выйти. В принципе, вот что я тестировал (nohup gnome-open *.pdf &); sleep 2; exit
Вариация на этом будет nohup gnome-open *.pdf && sleep 2 && exit