Мое понимание заключается в том, что установщик Ubuntu достаточно умен, чтобы удалять системные файлы, сохраняя при этом папку / home при установке поверх существующего Ubuntu. Для этого вам нужно убедиться, что Format Partition НЕ проверен - см. это для более подробной информации. [ ! d0]
И снова я твердо верю в модернизацию, в отличие от повторной установки. У меня есть несколько машин, которые постоянно обновлялись с 7.10 до текущего Ubuntu, включая несколько бета-версий. Были некоторые икоты, но в основном это вызвано попыткой выполнить dist-upgrade из не полностью обновленной системы.
Конечно, наличие резервной копии всегда отличная идея - даже если вы не переустанавливаете свою ОС.