Как вы говорите о «домашнем» сервере, я думаю, вы предпочитаете легкость и производительность, а NAS и медиасервер не используют столь высокие ресурсы.
Итак, я бы выбрал вариант 2, это сэкономит вам время и даст вам более удобную для пользователя систему с графическим доступом, если вам нужно.
Единственным недостатком является то, что графические компоненты возьмут некоторую оперативную память, но я думаю, что у вас достаточно для вашего использования.