Сообщение от bash говорит о том, что такого файла нет - я предлагаю вам дважды проверить, что вы находитесь в правильном каталоге, который действительно бит бит и т. д.
Попробуйте вызвать его как это:
cd ~/folder/where/you/unpacked-it
chmod +x ./eclipse
./eclipse
На самом деле даже изменение разрешений не требуется - в бинарнике уже установлен исполняемый бит.