Некоторые программы или приложения просто запускаются двоичным кодом. По имени приложения можно узнать, где находится бинарный файл.
whereis name-of-application
Пример:
$ whereis gparted
gparted: /usr/sbin/gparted /usr/share/man/man8/gparted.8.gz
Вы просто можете взять /usr/sbin/gparted - для запуска этого приложение, связанное с вводом значка или имени приложения (например, в cairo-dock). (в этом случае необходимо запустить gparted root-password).