Была та же проблема. «Sudo apt-get autoremove -f» и после удаления пакета i386 пакетов получил уведомление GUI для обновления дистрибутива.
Введите в терминале следующее:
sudo dpkg -i --force-overwrite /var/cache/apt/archives/opentracks_0.0.5-1_amd64.deb