Я предполагаю, что KDE является менеджером рабочего стола, а Kubuntu является официальным выпуском Ubuntu с помощью рабочего стола KDE.
С обновлением fglrx или без него у меня было несколько ошибок. Не только hugin, но и другие приложения. Я установил Ubuntu 13.04, и проблемы исчезли. Корень проблемы пока неизвестен, но мне все равно.