pipinstall дает & ldquo; Command & rdquo; python setup.py egg_info & ldquo; не удалось с кодом ошибки 1 & rdquo;

Я пытаюсь установить пакет python rpy2 с установкой pip на Ubuntu 16.04: pip install rpy2==2.2.7

, но получить сообщение об ошибке (см. полный вывод ниже):

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-EuOI6K/unroll/

] То же самое происходит с другими пакетами, например pip install unroll, или с помощью pip2. Я думал, что этот пост был той же проблемой, но там он разрешается с помощью sudo.

Решения пытались

Я пробовал решения в этой записи , например: pip install --upgrade setuptools, (sudo) easy_install -U setuptools или sudo apt-get install python-setuptools, но безрезультатно.

python / pip info

Кто-то предположил, что у меня может быть странная установка python / pip, вот несколько информации:

sudo which python pip pip2 | xargs -rd '\n' readlink -f /usr/bin/python2.7 /usr/local/bin/pip /usr/local/bin/pip2 sudo python --version Python 2.7.12 sudo pip --version pip 9.0.1 from /home/matifou/.local/lib/python2.7/site-packages (python 2.7) /usr/bin/pip2 --version pip 8.1.1 from /usr/lib/python2.7/dist-packages (python 2.7) ls -l $(which pip); dpkg -S /usr/bin/pip -rwxr-xr-x 1 root root 204 Nov 8 16:24 /usr/local/bin/pip python-pip: /usr/bin/pip

Полный вывод ошибки [ ! d9] pip install rpy2==2.2.7 Collecting rpy2==2.2.7 Using cached rpy2-2.2.7.tar.gz Complete output from command python setup.py egg_info: running egg_info creating pip-egg-info/rpy2.egg-info writing pip-egg-info/rpy2.egg-info/PKG-INFO writing top-level names to pip-egg-info/rpy2.egg-info/top_level.txt writing dependency_links to pip-egg-info/rpy2.egg-info/dependency_links.txt writing manifest file 'pip-egg-info/rpy2.egg-info/SOURCES.txt' Traceback (most recent call last): File "", line 1, in File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", line 462, in [os.path.join('doc', 'source', 'rpy2_logo.png')])], File "/usr/lib/python2.7/distutils/core.py", line 151, in setup dist.run_commands() File "/usr/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands self.run_command(cmd) File "/usr/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command cmd_obj.run() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py", line 280, in run self.find_sources() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py", line 295, in find_sources mm.run() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py", line 526, in run self.add_defaults() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py", line 562, in add_defaults sdist.add_defaults(self) File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/py36compat.py", line 36, in add_defaults self._add_defaults_ext() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/py36compat.py", line 119, in _add_defaults_ext build_ext = self.get_finalized_command('build_ext') File "/usr/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 312, in get_finalized_command cmd_obj.ensure_finalized() File "/usr/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 109, in ensure_finalized self.finalize_options() File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", line 155, in finalize_options config += get_rconfig(r_home, about) File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", line 319, in get_rconfig rc = RConfig.from_string(rconfig, allow_empty = allow_empty) File "/tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py", line 279, in from_string + '\nin string\n' + string) ValueError: Invalid substring -fopenmp in string -Wl,--export-dynamic -fopenmp -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro -L/usr/lib/R/lib -lR -lpcre -llzma -lbz2 -lz -lrt -ldl -lm Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/ pip install unroll Collecting unroll Using cached unroll-0.1.0.tar.gz Complete output from command python setup.py egg_info: Downloading http://pypi.python.org/packages/source/d/distribute/distribute-0.6.14.tar.gz Traceback (most recent call last): File "", line 1, in File "/tmp/pip-build-QimGjp/unroll/setup.py", line 2, in ez_setup.use_setuptools() File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py", line 145, in use_setuptools return _do_download(version, download_base, to_dir, download_delay) File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py", line 124, in _do_download to_dir, download_delay) File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py", line 193, in download_setuptools src = urlopen(url) File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", line 154, in urlopen return opener.open(url, data, timeout) File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", line 435, in open response = meth(req, response) File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", line 548, in http_response 'http', request, response, code, msg, hdrs) File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", line 473, in error return self._call_chain(*args) File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", line 407, in _call_chain result = func(*args) File "/usr/lib/python2.7/urllib2.py", line 556, in http_error_default raise HTTPError(req.get_full_url(), code, msg, hdrs, fp) urllib2.HTTPError: HTTP Error 403: SSL is required Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in tmp/pip- build-QimGjp/unroll/

7
задан 12 November 2017 в 09:36

5 ответов

Версия python-setuptools в репозитории пакетов Ubuntu 16.04 LTS устарела / не поддерживается. Обновите его с помощью pip вместо того, чтобы полагаться на диспетчер пакетов:

$ sudo pip install --upgrade setuptools
0
ответ дан 18 July 2018 в 03:27

вам нужно получить инструменты для установки, и, возможно, dev-модули напечатают следующий

sudo apt-get install python-setuptools sudo apt-get install python-dev

, возможно, имеет смысл сначала обновить pip, чтобы убедиться, что нет ничего, кроме плавного запуска, это делается путем ввода

sudo apt install python-pip

удачи

0
ответ дан 18 July 2018 в 03:27

Решение, которое я взял для моего собственного вопроса: предложенные ответы не решили проблему, поэтому я решил использовать conda, создав определенную среду для пакета, который мне нужен, и это сработало! Теперь это лучшее решение, тем более что для установки параллельной версии (вы можете использовать miniconda для пробела), но это практично!

0
ответ дан 24 July 2018 в 17:50

Версия python-setuptools в репозитории пакетов Ubuntu 16.04 LTS устарела / не поддерживается. Обновите его с помощью pip вместо того, чтобы полагаться на диспетчер пакетов:

$ sudo pip install --upgrade setuptools
0
ответ дан 24 July 2018 в 17:50

вам нужно получить инструменты для установки, и, возможно, dev-модули напечатают следующий

sudo apt-get install python-setuptools sudo apt-get install python-dev

, возможно, имеет смысл сначала обновить pip, чтобы убедиться, что нет ничего, кроме плавного запуска, это делается путем ввода

sudo apt install python-pip

удачи

0
ответ дан 24 July 2018 в 17:50
  • 1
    Благодарю. Но у меня на самом деле уже установлены эти три, к их новой версии ... – Matifou 12 November 2017 в 21:31

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: