Как я могу сделать многоэкранные настройки после перезагрузки?

Определенно звучит как ошибка.

Я бы предложил использовать Empathy для общения вместо веб-интерфейса, потому что я не испытывал этой проблемы с Empathy (или с веб-интерфейсом, если на то пошло). Вы можете сообщить об ошибке в пакете gnome-screensaver.

Вы также можете пометить ее как влияющую на chromium-browser (необязательно), потому что imo Chromium не должен отображать ничего, когда активна заставка или экран.