Настройки обоев kubuntu исчезают

Что касается расположения шрифтов, они сохраняются в /usr/share/fonts/ и /home/USERNAME/.fonts/. Это может быть несколько актуальным.

В файле unity-tweak-tool также есть раздел шрифта для изменения настроек шрифта по умолчанию. Возможно, попробуй.