apt-get install, каталог путей и запущенные программы зависимостей

Я очень новичок в Ubuntu, и, пожалуйста, несите меня, если я представляю версию объяснения очень непростой.

Моя ОС: сервер Ubuntu 11.10, 64-битная версия

Мне нужно используйте три инструмента samtools, bowtie и tophat. Однако tophat зависит от samtools и bowtie. Фактор зависимости - выяснить, где именно находится путь к двум вышеуказанным инструментам (samtools и bowtie).

Теперь я могу установить samtools и bowtie, используя sudo apt-get install, однако

  • Я точно не знаю, где существуют пути библиотек для samtools или bowtie
  • . В соответствии с примечаниями по установке tophat я должен извлечь инструмент из сжатого файла, изменить dir в этот файл и ./configure ; НО я не вижу скрипт ./configure в извлеченном каталоге

Samtools и Bowtie и Tophat находятся на их сайтах, это метод установки , который я пытаюсь выполнить.

3
задан Jorge Castro 4 February 2012 в 02:06
поделиться

8 ответов

1
ответ дан Chris Wayne 25 July 2018 в 17:01
поделиться

Чтобы узнать, где находятся библиотеки, вы можете попробовать dpkg -L samtools и то же самое для bowtie

1
ответ дан Chris Wayne 31 July 2018 в 10:46
поделиться
1
ответ дан Chris Wayne 1 August 2018 в 23:00
поделиться
1
ответ дан Chris Wayne 4 August 2018 в 14:39
поделиться
1
ответ дан Chris Wayne 5 August 2018 в 23:13
поделиться
1
ответ дан Chris Wayne 7 August 2018 в 16:47
поделиться
1
ответ дан Chris Wayne 10 August 2018 в 05:12
поделиться
1
ответ дан Chris Wayne 15 August 2018 в 17:16
поделиться

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: