Я решил эту проблему, понизив пакет python-crypto в ubuntu 16.04. Откат версии 2.6.1-6ubuntu0.16.04.2 до 2.6.1-6build1 с использованием команды ниже.
sudo apt-get install python-crypto=2.6.1-6build1
ref: https://forums.mysql.com/read.php?152,655178 , 655194 # сообщ-655194