Нет необходимости возвращаться к более старой версии. Вот решение, которое работало для меня с VLC 3 из репозитория master-daily:
Инструменты> Предпочтения> Видео> измените поле вывода по умолчанию на видеовыход x11 (XCB).
[d2 ] Нашел его в подобной теме.