Если это тема GTK +, то она оставила бы некоторые файлы в ~/.themes, возможно, также в ~/.icons и других.
Чтобы быть уверенным, вы можете вручную открыть сценарий удаления, найдите все папки, помеченные для удаления, и вручную очистите их самостоятельно.